تسلسل غرز

تسلسل الغرز (بالإنجليزية: insertion sequence)‏ واختصارا (IS) هو تسلسل دنا قصير يتصرف كينقول بسيط. لدى تسلسلات الغرز ميزتان أساسيتان: فهي صغيرة مقارنة بأنواع الينقولات الأخرى (طولها في العادة حوالي 700 إلى 2500 زوج قاعدي) ولا تشفِّـر سوى البروتينات التي لها علاقة بنشاط الانتقال (ومنه فهي مختلفة عن أنواع الينقولات الأخرى التي تحمل معها جينات إضافية مثل جينات مقاومة المضادات الحيوية). البروتينات التي تشفرها هذه التسلسلات في العادة هي: ترانسبوزاز وهو محفز يسمح لتسلسل الغرز بالانتقال، وكذلك بروتين منظم يقوم إما بحث أو تثبيط عملية الانتقال.

مركب ينقول بكتيري يوضح تسلسلا غرز على طرفيه كجزء من مكوناته.

تُحاط منطقة التشفير على طرفيها في تسلسل الغرز عادة بإعادات مقلوبة، على سبيل المثال التسلسل المقلوب المعروف 'IS911' الذي طوله 1250 زوج قاعدي يحوي على طرفيه إعادة مقلوبة طول كل واحدة منهما 69 زوج قاعدي وتحوي منطقته المشفِّرة على جينين متداخلين جزئيا 'orfA' و'orfAB' يشفران الترانسبوزاز (OrfAB) والبروتين المنظِّم (OrfA).[1][2][3][4]

يمكن أن تسمى تسلسلات غرز معينة تبعا للهيئة ISn حيث n عبارة عن رقم (مثال IS1 ،IS2 ،IS3 ،IS10 ،IS50 ،IS911 ،IS26 الخ)، لكن ليست هذه هي الطريقة الوحيدة للتسمية. رغم أن تسلسلات الغرز تتعلق بجينومات بدائيات النوى إلا أن بعض تسلسللات دنا حقيقيات النوى التي تنتمي إلى عائلة الينقولات Tc1/mariner يمكن أن تُعتبَر تسلسلات غرز.[5]

بالإضافة إلى وجودها مستقلة، يمكن لتسلسلات الغرز أن تظهر كأجزاء من مركب ينقولات، يتكون مركب الينقول من سلسلتي غرز جناحيتين، جين إضافي أو أكثر مثل جين مقاومة المضادات الحيوية (كمثال: Tn5، Tn10)، في حين يوجد نوع آخر من الينقولات يسمى وحدة ينقولات لا تحمل في أطرافها تسلسلات غرز كمثال Tn7.

لا يعتمد مركب الينقول على تسلسلات الغرز الجناحية لأنتاج إنزيم الريزولفاز، الريزولفاز جزء من جينوم المركب ويقص عند الإعادات المقلوبة الجناحية.

انظر أيضا

مراجع
  1. (بالإنجليزية) L. Haren, C. Normand, P. Polard, R. Alazard et M. Chandler, « IS911 transposition is regulated by protein-protein interactions via a leucine zipper motif », في Journal of Molecular Biology, vol. 296, no 3, 25 février 2000, ص.  757-768 [النص الكامل, lien PMID, lien DOI (pages consultées le 11 avril 2015)] نسخة محفوظة 24 سبتمبر 2015 على موقع واي باك مشين.
  2. (بالإنجليزية) L. Haren, P. Polard, B. Ton-Hoang et M. Chandler1, « Multiple oligomerisation domains in the IS911 transposase: a leucine zipper motif is essential for activity », في Journal of Molecular Biology, vol. 283, no 1, 16 octobre 1998, ص.  29-41 [النص الكامل, lien PMID, lien DOI (pages consultées le 11 avril 2015)]
  3. (بالإنجليزية) P. Polard et M. Chandler, « An in vivo transposase-catalyzed single-stranded DNA circularization reaction », في Genes & Development, vol. 9, no 22, 15 novembre 1995, ص.  2846-2858 [النص الكامل, lien PMID, lien DOI (pages consultées le 11 avril 2015)] نسخة محفوظة 5 فبراير 2020 على موقع واي باك مشين.
  4. (بالإنجليزية) P. Polard, M. F. Prere, O. Fayet et M. Chandler, « Transposase-induced excision and circularization of the bacterial insertion sequence IS911 », في The EMBO Journal, vol. 11, no 13, décembre 1992, ص.  5079-5090 [النص الكامل, lien PMID (pages consultées le 11 avril 2015)]
  5. Mahillon, Jacques; Chandler, Michael (1998-09-01). "Insertion Sequences". Microbiology and Molecular Biology Reviews (باللغة الإنجليزية). 62 (3): 725–774. ISSN 1092-2172. PMC 98933. PMID 9729608. مؤرشف من الأصل في 18 أبريل 2019. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
    • بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
    تسلسل غرز في المشاريع الشقيقة
    This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.