رنا صغير بكتيري

الرنا الصغير البكتيري (بالإنجليزية: Bacterial small RNA)‏ هو رنا غير مشفر صغير طوله حوالي 50-100 نوكليوتيد تُنتجه البكتيريا وهو ذو بنية منتظمة للغاية ويحتوي على العديد من الحلقات الجذعية.[1][2] تم تحديد الكثير من جزيئات الرنا الصغيرة باستخدام تقنيات تحليل حاسوبية وتقنيات مخبرية مثل: لطخة نورثرن، المصفوفات الدقيقة، سَلسَلة الرنا [3] في العديد من أجناس البكتيريا بما في ذلك الإشريكية القولونية،[4][5][6] النموذج الممرض من السلمونيلا،[7] بكتيريا سينوريزوبيوم ميليلوتي من عائلة متقلبات ألفا المثبتة للنيتروجين،[8] البكتيريا الزرقاء البحرية،[9] الفرنسيسيلة التولارية (العامل المسبب لداء توليري[10]العقدية المقيحة،[11] المكورة العنقودية الذهبية الممرضة،[12] وممرضة النبات المستصفرة الرزية.[13]

بنية رنا Qrr [الإنجليزية] الصغير، وظيفته تنظيم استشعار النصاب لدى أجناس بكتيريا الضمة.

يؤثر الرنا البكتيري الصغير على كيفية التعبير عن الجينات داخل الخلايا البكتيرية عبر التآثر مع الرنا الرسول أو البروتين، وبذلك يؤثر على مجموعة متنوعة من الوظائف البكتيرية كالأيض، حدة الجرثوم، الاستجابة للإجهاد البيئي والبنية.[7][12]

مراجع

  1. Vogel J, Wagner EG (June 2007). "Target identification of small noncoding RNAs in bacteria". Curr. Opin. Microbiol. 10 (3): 262–70. doi:10.1016/j.mib.2007.06.001. PMID 17574901. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  2. Viegas SC, Arraiano CM (2008). "Regulating the regulators: How ribonucleases dictate the rules in the control of small non-coding RNAs". RNA Biol. 5 (4): 230–43. doi:10.4161/rna.6915. PMID 18981732. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  3. Wassarman KM, Repoila F, Rosenow C, Storz G, Gottesman S (July 2001). "Identification of novel small RNAs using comparative genomics and microarrays". Genes Dev. 15 (13): 1637–51. doi:10.1101/gad.901001. PMC 312727. PMID 11445539. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  4. Hershberg R, Altuvia S, Margalit H (April 2003). "A survey of small RNA-encoding genes in Escherichia coli". Nucleic Acids Res. 31 (7): 1813–20. doi:10.1093/nar/gkg297. PMC 152812. PMID 12654996. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  5. Rivas E, Klein RJ, Jones TA, Eddy SR (September 2001). "Computational identification of noncoding RNAs in E. coli by comparative genomics". Curr. Biol. 11 (17): 1369–73. doi:10.1016/S0960-9822(01)00401-8. PMID 11553332. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  6. Argaman L, Hershberg R, Vogel J, et al. (June 2001). "Novel small RNA-encoding genes in the intergenic regions of Escherichia coli". Curr. Biol. 11 (12): 941–50. doi:10.1016/S0960-9822(01)00270-6. PMID 11448770. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  7. Vogel J (January 2009). "A rough guide to the non-coding RNA world of Salmonella". Mol. Microbiol. 71 (1): 1–11. doi:10.1111/j.1365-2958.2008.06505.x. PMID 19007416. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  8. Schlüter JP, Reinkensmeier J, Daschkey S, et al. (2010). "A genome-wide survey of sRNAs in the symbiotic nitrogen-fixing alpha-proteobacterium Sinorhizobium meliloti". BMC Genomics. 11: 245. doi:10.1186/1471-2164-11-245. PMC 2873474. PMID 20398411. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  9. Axmann IM, Kensche P, Vogel J, Kohl S, Herzel H, Hess WR (2005). "Identification of cyanobacterial non-coding RNAs by comparative genome analysis". Genome Biol. 6 (9): R73. doi:10.1186/gb-2005-6-9-r73. PMC 1242208. PMID 16168080. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  10. Postic G, Frapy E, Dupuis M, et al. (2010). "Identification of small RNAs in Francisella tularensis". BMC Genomics. 11: 625. doi:10.1186/1471-2164-11-625. PMC 3091763. PMID 21067590. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  11. Tesorero, Rafael A.; Yu, Ning; Wright, Jordan O.; Svencionis, Juan P.; Cheng, Qiang; Kim, Jeong-Ho; Cho, Kyu Hong (2013-01-01). "Novel regulatory small RNAs in Streptococcus pyogenes". PLOS One. 8 (6): e64021. doi:10.1371/journal.pone.0064021. ISSN 1932-6203. PMC 3675131. PMID 23762235. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  12. Felden, Brice; Vandenesch, François; Bouloc, Philippe; Romby, Pascale (2011-03-10). "The Staphylococcus aureus RNome and Its Commitment to Virulence". PLoS Pathogens. 7 (3). doi:10.1371/journal.ppat.1002006. ISSN 1553-7366. PMC 3053349. PMID 21423670. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  13. Liang H, Zhao YT, Zhang JQ, Wang XJ, Fang RX, Jia YT (2011). "Identification and functional characterization of small non-coding RNAs in Xanthomonas oryzae pathovar oryzae". BMC Genomics. 12: 87. doi:10.1186/1471-2164-12-87. PMC 3039613. PMID 21276262. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
    • بوابة الكيمياء الحيوية
    • بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
    This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.