حلقة د

الحلقة د (بالإنجليزية: D-loop)‏ أو حلقة الإزاحة (displacement loop) هي بنية دنا تنفصل فيها سلسلتا جزيء دنا مضاعف السلسلة لطول معين بواسطة سلسلة دنا ثالثة. الحلقة ر مشابهة للحلقة د لكن تختلف عنها في كون السلسلة الثالثة سلسلة رنا بدل دنا. تسلسل قواعد السلسلة الثالثة يكون مكملا لإحدى السلسلتين الرئيسيتين ويترابط معها، مزيحا السلسلة المكملة الرئيسية الأخرى في تلك المنطقة، ومنه تتشكل هيئة من دنا ثلاثي السلاسل. صورة في البحث الذي يعرف المصطلح (حلقة د) توضح الحلقة د بشكل يشابه الحرف "D" حيث تشكل سلسلة الإزاحة حلقة على شكل حرف D. [1]

تظهر حلقات د في عدة حالات خاصة منها: ترميم الدنا، القسيمات الطرفية وفي البنيات نصف-مستقرة في جزيئات دنا المتقدرة الدائري.

في المتقدرة

أظهرت أبحاث في معهد كاليفورنيا للتقنية سنة 1971 أن دنا المتقدرة الدائري لخلايا في طور النمو يحوي قطعا قصيرة من ثلاث سلاسل سميت حلقة الإزاحة.[1] ووُجِد أن السلسلة الثالثة هي قطعة منسوخة من السلسلة الثقيلة (أو سلسلة-H) للجزيء، التي تمت إزاحتها وتم ارتباط السلسلة الثالثة بالسلسلة الخفيفة (أو سلسلة-L)، ومنذ ذلك ظهر بأن السلسلة الثالثة هي السلسلة الابتدائية المُنتَجة بواسطة تضاعف السلسلة الثقيلة والتي توقفت عن العمل بعد وقت قصير من بدء عملية الترجمة، حيث تتم المحافظة عليها لمدة معينة على تلك الحالة.[2] تظهر الحلقة د في المنطقة الرئيسية غير المشفِّرة لجزيء دنا المتقدرة في قطعة تسمى منطقة التحكم أو منطقة الحلقة د.

يمكن أن يحدث تضاعف الدنا المتقدرة بطريقتين مختلفتين، كلاهما يبدأ في منطقة الحلقة د. [3] إحدى الطريقتين تستمر في مضاعفة السلسلة الثقيلة على طول جزء مهم (ثلثين مثلا) من الجزء الدائري، وبعدها يبدأ تضاعف السلسلة الخفيفة، والطريقة الثانية التي ذكرت حديثا تبدأ في منطقة مختلفة من منطقة الحلقة د ويستخدم تضاعف السلسلة-المزدوجة يكون فيه تخليق كلا السلسلتين في آن واحد. [3][4]

بعض القواعد في منطقة الحلقة د يتم الحفاظ عليها، لكن أجزاء كبيرة منها متغيرة بشكل كبير، وقد أثبتت المنطقة أنها مفيدة لدراسة التاريخ التطوري للفقاريات.[5] تحتوي المنطقة على محفزات لنسخ الرنا من سلسلتي دنا المتقدرة، وهي مجاورة لبنية الحلقة د المتعلقة ببدء عملية مضاعفة الدنا [6]، كما أن تسلسلات الحلقة د مهمة في دراسة السرطان. [7]

وظيفة الحلقة د غير واضحة حتى الآن، لكن أبحاثا حديثة تقترح أنها تساهم في تنظيم نوواني المتقدرة. [8][9]

في القسيمات الطرفية

تم سنة 199 التقرير بأن القسيمات الطرفية التي تُقبّع نهايات الكروموسومات لها نهايات تشبه الوهق وتسمى حلقة ت [10]، وهي حلقة من كلا سلسلتي الكروموسوم ارتبطتا في نقطة سابقا بواسطة النهاية 3' للسلسة الثالثة جاعلة إيها تشكل حلقة د، حيث يقوم بروتين مختص بالعمل على استقرار هذا الترابط. تحمي الحلقة ت التي تكتمل بحلقة د ملصقة نهاية الكروموسوم من الضرر. [11]

مراجع
  1. Kasamatsu, H.; Robberson, D. L.; Vinograd, J. (1971). "A novel closed-circular mitochondrial DNA with properties of a replicating intermediate". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 68 (9): 2252–2257. Bibcode:1971PNAS...68.2252K. doi:10.1073/pnas.68.9.2252. PMC 389395. PMID 5289384. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  2. Doda, J. N.; Wright, C. T.; Clayton, D. A. (1981). "Elongation of displacement-loop strands in human and mouse mitochondrial DNA is arrested near specific template sequences". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 78 (10): 6116–6120. Bibcode:1981PNAS...78.6116D. doi:10.1073/pnas.78.10.6116. PMC 348988. PMID 6273850. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  3. Fish, J.; Raule, N.; Attardi, G. (2004). "Discovery of a major D-loop replication origin reveals two modes of human mtDNA synthesis". Science. 306 (5704): 2098–2101. Bibcode:2004Sci...306.2098F. doi:10.1126/science.1102077. PMID 15604407. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  4. Holt, I. J.; Lorimer, H. E.; Jacobs, H. T. (2000). "Coupled leading- and lagging-strand synthesis of mammalian mitochondrial DNA". Cell. 100 (5): 515–524. doi:10.1016/s0092-8674(00)80688-1. PMID 10721989. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  5. Larizza, A.; Pesole, G.; Reyes, A.; Sbisà, E.; Saccone, C. (2002). "Lineage specificity of the evolutionary dynamics of the mtDNA D-loop region in rodents". Journal of Molecular Evolution. 54 (2): 145–155. doi:10.1007/s00239-001-0063-4. PMID 11821908. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  6. Chang, D. D.; Clayton, D. A. (1985). "Priming of human mitochondrial DNA replication occurs at the light-strand promoter". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 82 (2): 351–355. Bibcode:1985PNAS...82..351C. doi:10.1073/pnas.82.2.351. PMC 397036. PMID 2982153. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  7. Akouchekian, M.; Houshmand, M.; Hemati, S.; Ansaripour, M.; Shafa, M. (2009). "High Rate of Mutation in Mitochondrial DNA Displacement Loop Region in Human Colorectal Cancer". Diseases of the Colon & Rectum. 52 (3): 526–530. doi:10.1007/DCR.0b013e31819acb99. PMID 19333057. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  8. He, J.; Mao, C. -C.; Reyes, A.; Sembongi, H.; Di Re, M.; Granycome, C.; Clippingdale, A. B.; Fearnley, I. M.; Harbour, M.; Robinson, A. J.; Reichelt, S.; Spelbrink, J. N.; Walker, J. E.; Holt, I. J. (2007). "The AAA+ protein ATAD3 has displacement loop binding properties and is involved in mitochondrial nucleoid organization". The Journal of Cell Biology. 176 (2): 141–146. doi:10.1083/jcb.200609158. PMC 2063933. PMID 17210950. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  9. Leslie, M. (2007). "Thrown for a D-loop". The Journal of Cell Biology. 176 (2): 129a. doi:10.1083/jcb.1762iti3. PMC 2063944. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  10. Griffith, J. D.; Comeau, L.; Rosenfield, S.; Stansel, R. M.; Bianchi, A.; Moss, H.; De Lange, T. (1999). "Mammalian telomeres end in a large duplex loop". Cell. 97 (4): 503–514. doi:10.1016/S0092-8674(00)80760-6. PMID 10338214. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  11. Greider, C. W. (1999). "Telomeres do D-loop-T-loop". Cell. 97 (4): 419–422. doi:10.1016/S0092-8674(00)80760-6. PMID 10338204. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
    • بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
    This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.