تنبؤ بتآثر بروتين-بروتين

التنبؤ بتآثر بروتين-بروتين (بالإنجليزية: Protein–protein interaction prediction)‏ هو مجال يجمع بين المعلوماتية الحيوية وعلم الأحياء البنيوي في محاولةٍ لتحديد وفهرسة التآثرات الفيزيائية بين أزواج أو مجموعات البروتينات. فهم تآثرات البروتين-بروتين مهم في سبيل تقصي مسارات التأشير داخل الخلوية، نمذجة وتحديد بنُى المركبات البروتينية وللحصول على رؤىً وأفكارٍ حول مختلف العمليات البيوكيميائية.

برفلة تطور السلالات ^{[الإنجليزية]}: بروفايلات فيلوجينية لأربع جينات (C ،B ،A وD) مبينة يمينا. الرقم 1 يرمز لتواجد الجين في الجينوم و0 إلى غيابه. البروفايلان المتماثلان A وB موضحان بالأصفر.[1]

تجريبيا، يمكن استنتاج التآثرات الفيزيائية بين أزواج البروتينات من خلال العديد من التقنيات منها: أنظمة الهجينين الخميري، مقايسة تتام القطعة البروتينية ^{[الإنجليزية]} (PCA)، التنقية حسب الألفة/ مطيافية الكتلة، مصفوفات البروتين الدقيقة، انتقال طاقة رنين فورستر ^{[الإنجليزية]} (FRET) والرحلان الحراري ميكروي النطاق ^{[الإنجليزية]} (MST). هنالك مجهودات جارية لتحديد التآثروم الخاص بالعديد من الأجناس. عادة ما توفر التآثرات المحدَّدَة تجريبيا الأساس للتقنيات الحاسوبية للتنبؤ بالتآثرات المماثلة والشبيهة، على سبيل المثال: استخدام تسلسل بروتيني متماثل بين عدة أجناس. مع ذلك توجد طرق تتنبؤ بتآثرات جديدة من دون وجود معلومات سابقة حول تآثرات مماثلة.

مراجع

Raman, Karthik (2010-02-15). "Construction and analysis of protein–protein interaction networks". Automated Experimentation. 2 (1): 2. doi:10.1186/1759-4499-2-2. ISSN 1759-4499. PMC 2834675. PMID 20334628. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)

بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
بوابة تقانة حيوية

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[:0-1] Raman, Karthik (2010-02-15). "Construction and analysis of protein–protein interaction networks". Automated Experimentation. 2 (1): 2. doi:10.1186/1759-4499-2-2. ISSN 1759-4499. PMC 2834675. PMID 20334628. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)