قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات

قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات (بالإنجليزية: Structural Classification of Proteins database)‏ (مختصرها سكوب أو SCOP) هو دليل تصنيفي إلى حد كبير في المجالات الهيكلية للبروتين على أساس تشابه هياكلها وتسلسل الأحماض الأمينية. الدافع وراء هذا التصنيف هو تحديد العلاقة التطورية بين البروتينات. توضع البروتينات التي تتصف بأشكال متشابهة ولكنها تتصف بوجود القليل من التشابه في التسلسل أو الوظيفة في عوائل رئيسية مختلفة، لكن توضع فرضية أن السلف المشترك بعيد جداً، كما توضع البروتينات التي لها نفس الشكل وبعض التشابه في التسلسل أو الوظيفة في الأسر ذاتها، ويفترض أن يكون لها سلف مشترك أوثق.

SCOP
قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات
معلومات عامة
عنوان الموقع
نوع الموقع
قاعدة بيانات عن مجالات البروتينات
تاريخ الإطلاق
1994
الوضع الحالي
الإصدار الحالي 1.75 (حزيران 2009)
المنظومة الاقتصادية
المقر الرئيسي
مختبر علم الأحياء الجزيئي [الإنجليزية] - كامبريدج في إنجلترا

قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات يمكن الوصول إليها بحرية على شبكة الانترنت. أنشئت قاعدة البيانات في عام 1994.[1] يصونها أليكسي مورزين وزملاؤه في مختبر علم الأحياء الجزيئي [الإنجليزية] في كامبريدج في إنجلترا.[2][3][4]

في آب 2013، كان الإصدار الحالي من قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات هو 1.75 (والذي صدر حزيران 2009). نسخة من الإصدار التالي من قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات، وهو ما يسمى بري-سكوب (pre-SCOP)، يمكن الوصول إليها من الصفحة الرئيسية لقاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات.

بري-سكوب (pre-SCOP) يقصد بها نظرة عامة أو معاينة لقاعدة البيانات وأصلها من كلمة (preview) الإنجليزية.

المصادر

  1. PMID 18000004 (ببمد 18000004)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  2. Hubbard, T. J.; Ailey, B.; Brenner, S. E.; Murzin, A. G.; Chothia, C. (1999). "SCOP: A Structural Classification of Proteins database". Nucleic Acids Research. 27 (1): 254–256. doi:10.1093/nar/27.1.254. PMC 148149. PMID 9847194. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  3. Lo Conte, L.; Ailey, B.; Hubbard, T. J.; Brenner, S. E.; Murzin, A. G.; Chothia, C. (2000). "SCOP: A Structural Classification of Proteins database". Nucleic Acids Research. 28 (1): 257–259. doi:10.1093/nar/28.1.257. PMC 102479. PMID 10592240. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
  4. PMID 14681400 (ببمد 14681400)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
    • بوابة الكيمياء الحيوية
    This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.