UPF1

UPF1
التراكيب المتوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	2GJK, 2GK6, 2GK7, 2IYK, 2WJV, 2WJY, 2XZO, 2XZP
المعرفات
الأسماء المستعارة	UPF1, H, NORF1, RENT1, pNORF1, smg-2, RNA helicase and ATPase, RNA helicase and ATPase
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 601430 MGI: MGI:107995 HomoloGene: 2185 GeneCards: 5976
علم الوجود الجيني
الوظيفة الجزيئية	• nucleotide binding; • ربط دي إن إي; • telomeric DNA binding; • ربط أيون الزنك; • chromatin binding; • ربط أيون فلزي; • ‏GO:0001948 ربط بروتيني; • نشاط هيدرولاز; • ATP binding; • ‏GO:0008026 helicase activity; • RNA binding;
المكونات الخلوية	• عصارة خلوية; • P-body; • exon-exon junction complex; • supraspliceosomal complex; • بلازم نووي; • كروماتين; • nuclear chromosome, telomeric region; • سيتوبلازم; • نواة;
العمليات الحيوية	• regulation of translational termination; • telomere maintenance via semi-conservative replication; • positive regulation of mRNA catabolic process; • mRNA export from nucleus; • تنسخ الحمض النووي الريبي منقوص الأكسجين; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process; • cellular response to interleukin-1; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, endonucleolytic cleavage-dependent decay; • histone mRNA catabolic process; • dosage compensation by inactivation of X chromosome; • cellular response to lipopolysaccharide; • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization; • ترميم الدنا; • تفكك متوسط بلا معنى; • regulation of telomere maintenance; • cell cycle phase transition; • ‏GO:0022415 viral process;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	; ;
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
أورثولوج
	Q92900; A0A024R7L8
	Q9EPU0
	‏NM_001297549، ‏XM_017027105، ‏XM_017027106 NM_002911، ‏NM_001297549، ‏XM_017027105، ‏XM_017027106
	‏NM_030680، ‏XM_006509604، ‏XM_006509605 NM_001122829، ‏NM_030680، ‏XM_006509604، ‏XM_006509605
	‏NP_002902، ‏XP_016882594، ‏XP_016882595 NP_001284478، ‏NP_002902، ‏XP_016882594، ‏XP_016882595; NP_001284478.1
	‏NP_109605، ‏XP_006509667، ‏XP_006509668 NP_001116301، ‏NP_109605، ‏XP_006509667، ‏XP_006509668
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

UPF1‏ (UPF1, RNA helicase and ATPase) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين UPF1 في الإنسان.[1][2]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل، ساهم بتحريره.

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل، ساهم بتحريره.

المراجع

Applequist SE, Selg M, Raman C, Jack HM (March 1997). "Cloning and characterization of HUPF1, a human homolog of the Saccharomyces cerevisiae nonsense mRNA-reducing UPF1 protein". Nucleic Acids Res. 25 (4): 814–21. doi:10.1093/nar/25.4.814. PMC 146496. PMID 9064659. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Perlick HA, Medghalchi SM, Spencer FA, Kendzior RJ Jr, Dietz HC (November 1996). "Mammalian orthologues of a yeast regulator of nonsense transcript stability". Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (20): 10928–32. doi:10.1073/pnas.93.20.10928. PMC 38260. PMID 8855285. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)

قراءة متعمقة

Azzalin CM, Lingner J (2006). "The double life of UPF1 in RNA and DNA stability pathways". Cell Cycle. 5 (14): 1496–8. doi:10.4161/cc.5.14.3093. PMID 16861888. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Horikoshi M, Sekimizu K, Natori S (1984). "Analysis of the stimulatory factor of RNA polymerase II in the initiation and elongation complex". J. Biol. Chem. 259 (1): 608–11. PMID 6200476. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Nagase T, Seki N, Ishikawa K, et al. (1997). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. VI. The coding sequences of 80 new genes (KIAA0201-KIAA0280) deduced by analysis of cDNA clones from cell line KG-1 and brain". DNA Res. 3 (5): 321–9, 341–54. doi:10.1093/dnares/3.5.321. PMID 9039502. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Czaplinski K, Ruiz-Echevarria MJ, Paushkin SV, et al. (1998). "The surveillance complex interacts with the translation release factors to enhance termination and degrade aberrant mRNAs". Genes Dev. 12 (11): 1665–77. doi:10.1101/gad.12.11.1665. PMC 316864. PMID 9620853. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Page MF, Carr B, Anders KR, et al. (1999). "SMG-2 Is a Phosphorylated Protein Required for mRNA Surveillance in Caenorhabditis elegans and Related to Upf1p of Yeast". Mol. Cell. Biol. 19 (9): 5943–51. PMC 84455. PMID 10454541. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Bhattacharya A, Czaplinski K, Trifillis P, et al. (2000). "Characterization of the biochemical properties of the human Upf1 gene product that is involved in nonsense-mediated mRNA decay". RNA. 6 (9): 1226–35. doi:10.1017/S1355838200000546. PMC 1369996. PMID 10999600. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Mendell JT, Medghalchi SM, Lake RG, et al. (2000). "Novel Upf2p Orthologues Suggest a Functional Link between Translation Initiation and Nonsense Surveillance Complexes". Mol. Cell. Biol. 20 (23): 8944–57. doi:10.1128/MCB.20.23.8944-8957.2000. PMC 86549. PMID 11073994. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Serin G, Gersappe A, Black JD, et al. (2001). "Identification and Characterization of Human Orthologues to Saccharomyces cerevisiae Upf2 Protein and Upf3 Protein (Caenorhabditis elegans SMG-4)". Mol. Cell. Biol. 21 (1): 209–23. doi:10.1128/MCB.21.1.209-223.2001. PMC 88795. PMID 11113196. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Lykke-Andersen J, Shu MD, Steitz JA (2001). "Human Upf proteins target an mRNA for nonsense-mediated decay when bound downstream of a termination codon". Cell. 103 (7): 1121–31. doi:10.1016/S0092-8674(00)00214-2. PMID 11163187. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Denning G, Jamieson L, Maquat LE, et al. (2001). "Cloning of a novel phosphatidylinositol kinase-related kinase: characterization of the human SMG-1 RNA surveillance protein". J. Biol. Chem. 276 (25): 22709–14. doi:10.1074/jbc.C100144200. PMID 11331269. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Yamashita A, Ohnishi T, Kashima I, et al. (2001). "Human SMG-1, a novel phosphatidylinositol 3-kinase-related protein kinase, associates with components of the mRNA surveillance complex and is involved in the regulation of nonsense-mediated mRNA decay". Genes Dev. 15 (17): 2215–28. doi:10.1101/gad.913001. PMC 312771. PMID 11544179. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Lykke-Andersen J, Shu MD, Steitz JA (2001). "Communication of the position of exon-exon junctions to the mRNA surveillance machinery by the protein RNPS1". Science. 293 (5536): 1836–9. doi:10.1126/science.1062786. PMID 11546874. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Carastro LM, Tan CK, Selg M, et al. (2002). "Identification of delta helicase as the bovine homolog of HUPF1: demonstration of an interaction with the third subunit of DNA polymerase delta". Nucleic Acids Res. 30 (10): 2232–43. doi:10.1093/nar/30.10.2232. PMC 115286. PMID 12000843. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Mendell JT, ap Rhys CM, Dietz HC (2002). "Separable roles for rent1/hUpf1 in altered splicing and decay of nonsense transcripts". Science. 298 (5592): 419–22. doi:10.1126/science.1074428. PMID 12228722. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Lykke-Andersen J (2003). "Identification of a Human Decapping Complex Associated with hUpf Proteins in Nonsense-Mediated Decay". Mol. Cell. Biol. 22 (23): 8114–21. doi:10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002. PMC 134073. PMID 12417715. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Chiu SY, Serin G, Ohara O, Maquat LE (2003). "Characterization of human Smg5/7a: A protein with similarities to Caenorhabditis elegans SMG5 and SMG7 that functions in the dephosphorylation of Upf1". RNA. 9 (1): 77–87. doi:10.1261/rna.2137903. PMC 1370372. PMID 12554878. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)
Schell T, Köcher T, Wilm M, et al. (2003). "Complexes between the nonsense-mediated mRNA decay pathway factor human upf1 (up-frameshift protein 1) and essential nonsense-mediated mRNA decay factors in HeLa cells". Biochem. J. 373 (Pt 3): 775–83. doi:10.1042/BJ20021920. PMC 1223536. PMID 12723973. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)

بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
بوابة طب
بوابة الكيمياء الحيوية

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[pmid9064659-1] Applequist SE, Selg M, Raman C, Jack HM (March 1997). "Cloning and characterization of HUPF1, a human homolog of the Saccharomyces cerevisiae nonsense mRNA-reducing UPF1 protein". Nucleic Acids Res. 25 (4): 814–21. doi:10.1093/nar/25.4.814. PMC 146496. PMID 9064659. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)

[pmid8855285-2] Perlick HA, Medghalchi SM, Spencer FA, Kendzior RJ Jr, Dietz HC (November 1996). "Mammalian orthologues of a yeast regulator of nonsense transcript stability". Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (20): 10928–32. doi:10.1073/pnas.93.20.10928. PMC 38260. PMID 8855285. الوسيط |CitationClass= تم تجاهله (مساعدة)